在旅行的列车上，美雪（铃木杏 饰）再次邂逅了金田一（松本润 饰），并追随于他。同伴用手中的DV记录着发生的一切。某夜，一个木偶团长不幸被害。案发后，警探发现他原本在车厢里的尸体不翼而飞，于是引起了一阵骚乱。探长决定在一家酒店暂时住下，找寻犯罪嫌疑人，金田一等人也一同前往。后来，根据案情，嫌疑人被锁定在木偶团体成员之中，探长想通过体重以缩小搜查范围。但是，一个女成员的意外死亡，却让金田一发现了隐...

5年前，也就是发生警视厅副总监绑架事件的5年前，湾岸还是一片普通的地方。如今，这里已经建设了每年4000万游客的观光线路。随着观光客的增加，湾岸发生的案件更加复杂与多样。是次的连续猎奇杀人事件，便是令警视厅上下都坐立不安的案件。毫无线索的凶手，凶残的杀人手法。青岛俊作（织田裕二饰）带领女同事小堇（深津绘里饰）、从美国留学回来的谈判专家真下正义（中山裕介饰）一起，向犯罪分子宣战，一定要保卫湾岸的和平...